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Pipeline used to tranfert gene annotation (GFF3) between different versions of assemblies.

Traduction française des FAIR4RS Principles (voir README)

panTEannot serially annotates transposable elements from multiple genomes using a common reference library. The annotation is a light version of TEannot from REPET package. These annotations can be used as input for the panREPET tool.

Présentation de git et de son écosystème dans le cadre des rencontres ingénieurs statisticiens de Toulouse (dec. 2021).

https://umrf.pages.mia.inra.fr/ranomaly/

Server : https://shiny.migale.inrae.fr/app/easy16S | Doc : https://easy16s.migale.inrae.fr/

Electron Desktop App For Bisulfite Sequencing Processing Software (BiSePS)

Organisation d'un bootcamp autour de l'intégration et la visualisation de données avec Neo4J, adossé en amont d'une formation Neo4J en ligne.

Site web : https://work4graph.pages.mia.inra.fr/bootcamp-neo4j-2022/

GenoFig is a tool for graphical vizualisation of annotated genetic regions, and homologous regions comparison. It was designed to be as easy to use as possible for biologists.

List of workflows (nextflow/snakemake) tested for Genotoul Cluster.